Há três anos, apareceu uma raça sanguinária de seres interdimensionais conhecidos como os Desastres, que destruiu tudo o que eles podiam alcançar na Terra. Com armas regulares tornadas inúteis, a humanidade's única esperança de sobrevivência dependia dos humanos que se tornaram meninas mágicas depois de formar uma aliança com o Reino Espiritual, que tinha seguido as Desas para a Terra. Após um violento conflito, o esquadrão de meninas mágicas emerge vitorioso, com as sobreviventes agora conhecidas como as "Magical Five."
Após a guerra com os Disas, os Cinco Mágicos desbaratam. Kurumi Mugen, Mia Cyrus, Tamara Volkova e Lau Peipei continuam seus próprios serviços militares independentemente, enquanto seu líder, Asuka Ootorii, se aposenta e se torna um estudante do ensino médio. Contudo, a paz de Asuka's é de curta duração, pois parece que houve sobreviventes do lado do inimigo's também. Como a magia deve ser combatida com magia, Asuka é arrastada de volta para o combate enquanto uma batalha ainda pior paira no horizonte.
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