No ano da Era Cósmica 0071, uma briga de guerra entre dois mobile suit resulta na destruição de um país neutro. Shinn Asuka encontra toda a sua família morta como vítimas da violência e jura sua vida em uma perseguição vingativa às forças naturais da Terra, com a impressão de que foram eles os responsáveis pela morte de sua família. Shinn sobe nas forças militares da ZAFT, eventualmente obtendo acesso à cabine do protótipo do mobile suit Impulse.
Athrun Zala, um veterano da guerra recente empregado ao serviço do diplomata Cagalli Yula Athha, vê-se envolvido num novo conflito entre os Naturais e os Coordenadores: seres humanos melhorados artificialmente antes do nascimento e odiados pelos Naturais pelas suas vantagens biológicas.
À medida que a nova guerra surge e a violência se torna inevitável, Athrun se torna o mentor do amargo Shinn. Athrun deve conduzir o jovem piloto a uma mentalidade de misericórdia antes que sua raiva e desejo de vingança o consumam.
[Written by MAL Rewrite]
