Kimihiro Watanuki pode ver espíritos e outras criaturas sobrenaturais variadas, o que é uma habilidade bastante incômoda da qual ele não gosta muito. No caminho de casa, um dia, enquanto atormentado por alguns espíritos, ele é inexplicavelmente obrigado a entrar em uma casa estranha. Lá, ele encontra Yuuko, uma mulher misteriosa que afirma ser capaz de livrá-lo da capacidade de ver e atrair as criaturas problemáticas—por um preço. Ela exige que ele trabalhe em sua "loja" isso concede desejos às pessoas, e assim começa as aventuras de Watanuki's através de eventos estranhos e maravilhosos.
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