Segunda temporada de Hyakka Ryoran: Samurai Girls. Com sua paisagem deslumbrante e seu povo próspero, o Grande Japão é a inveja de todas as outras nações. Mas uma séria ameaça paira sobre o país. Guardiões misteriosos conhecidos como Mestre Samurai são a única defesa do Grande Japão.
A pedido do conselho estudantil, o jovem samurai Muneakira Yagyuu chega à Escola Acadêmica de Buou. Administrada pelo Shogunato Tokugawa, aqui os filhos dos guerreiros recebem a educação aristocrática necessária para administrar o país. A escola é dirigida pelo presidente do conselho estudantil, Yoshihiko Tokugawa, e sua irmã Sen, que também é amiga de infância de Muneakira.
