Num futuro distante, a humanidade está a ser atacada pelo Império Abh, uma raça de seres humanóides avançados com uma tecnologia muito superior. À medida que inúmeros mundos caem nas mãos dos Abh, a humanidade estabelece a Aliança das Quatro Nações – uma fação de resistência composta pela Humanidade Unida, a República de Greater Alcont, a Federação de Hania e o Soberano do Povo dos Planetas da União.
Seikai no Monshou conta a história de Jinto Linn. Quando era jovem, o seu pai – o presidente de Martine – vendeu o seu mundo em troca de uma posição elevada no império. Agora um jovem conde, Jinto tem de aprender os costumes da nobreza Abh e viver entre aqueles que subjugaram o seu povo. A ajudá-lo está Lafiel Abriel, uma austera princesa Abh de quem Jinto rapidamente se torna amigo. Enquanto viajam para a nova escola de Jinto na terra natal dos Abh, a sua nave é apanhada numa violenta batalha espacial entre as frotas da Aliança e dos Abh. Jinto e Abriel são empurrados para o conflito, sem saberem que esta escaramuça marca o início de uma guerra em grande escala entre o Império Abh e a humanidade.
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