Desde os primórdios dos tempos, houve guerreiros que protegeram a Deusa Atena. Uma vez aparecidas as forças do mal, esses guerreiros, chamados de Santos, se apresentarão.
Uma jovem mulher, Saori Kido, aprende sobre esta força conhecida como "Cosmos" e que ela é a reencarnação de Atena, protetora do amor e da paz na Terra. No entanto, o Papa do Santuário, que está a cargo de todos os santos, não tem a amabilidade de Saori, e a visa para usurpar a identidade de Atena. Um assassino é enviado para matá-la. Felizmente, um dos Santos de Bronze, Seiya, consegue protegê-la. Mas a Seiya será capaz de proteger Saori até o fim na saga apaixonante de Saint Seiya: Lenda do Santuário?
