Ao bater da meia-noite, surge a Hora Escura – uma hora secreta que a maioria desconhece. Aqueles que não estão presos em caixões durante essa hora, com a infelicidade de se encontrarem conscientes, são recebidos por criaturas perigosas conhecidas como Sombras. Alguns poucos, no entanto, possuem o potencial de usar a Persona: um poder especial usado para derrotar esses seres. Esse grupo secreto é chamado de SEES (Specialized Extracurricular Execution Squad), e sua missão é descobrir a razão por trás do aparecimento da Dark Hour.
Pouco tempo depois de o estudante transferido Makoto Yuuki começar a residir no Iwatodai Dormitório, sua Persona desperta após um ataque de uma forte Sombra. Agora recrutado para as fileiras do SEES, ele começa a lutar ao lado de seus companheiros, pois somente eles podem proteger a humanidade das Sombras e impedir a anomalia que é a Dark Hour.
[Written by MAL Rewrite]
