É o Século Universal 0153. Nas colônias espaciais localizadas em Side 2, o Império Zanscare chegou ao poder e o mantém através do uso aberto da guilhotina. Com suas forças invadindo a Terra e suas frotas espaciais preparando-se para subjugar os outros Sides, o Império Zanscare não tem nada a temer da enfraquecida Federação Terrestre. Apenas a Liga Militar, com armaduras móveis de última geração e jovens pilotos constituem o único movimento de resistência real. Agora, Uso Evin, de treze anos, foi arrastado para a guerra por uma batalha perto de sua casa na Europa Oriental. Como o piloto Newtype do Victory Gundam, ele luta não só para derrotar o Império Zanscare, mas também para descobrir o que aconteceu com seus pais, que o deixaram para trás quando foram ao espaço.
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