Os protagonistas do Futari wa Precure Nagisa Misumi e Honoka Yukishiro são quase tão diferentes quanto duas pessoas podem ser. Nagisa é o capitão da equipe de lacrosse, um amante da comida, e um odiador dos deveres de casa. Honoka adora aprender, trabalhando com o clube de ciências e ganhando o apelido de "A Rainha do Conhecimento" de seus colegas de classe. Suas vidas são desconectadas até que um dia, quando uma misteriosa chuva estelar os une.
Nagisa e Honoka conhecem Mipple e Mepple, dois residentes do Jardim da Luz. Sua terra natal foi conquistada pelas forças malignas da Zona Escura que agora estão de olho no Jardim do Arco-íris: A Terra. Com poderes do Jardim da Luz, Nagisa se torna Preto Curado e Honoka se torna Branco Curado. Juntos, eles são Pretty Cure! Agora a Pretty Cure deve localizar as Pedras do Prisma, o único poder forte o suficiente para derrotar a Zona Escura e reparar os danos causados ao Jardim da Luz. Será que estas meninas mágicas serão capazes de proteger sua casa contra o mal que a ameaça? Ou serão sugadas para a escuridão?
