Com a promessa de conceder qualquer desejo, o onipotente Santo Graal desencadeou três guerras no passado, cada uma demasiado cruel e feroz para deixar um vitorioso. Apesar disso, a rica família Einzbern está confiante de que a Quarta Guerra do Santo Graal será diferente; isto é, com um vaso do Santo Graal agora ao seu alcance. Somente por esta razão, o muito odiado " Magus Killer" Kiritsugu Emiya é contratado pelos Einzberns, com casamento com sua única filha Irisviel como contrato de vínculo.
Kiritsugu está agora no centro de um jogo de sobrevivência, enfrentando seis outros participantes, cada um armado com um antigo familiar, e alimentado por desejos e ideais únicos. Acompanhado pelo seu próprio familiar, Saber, o notório mercenário logo encontra o seu maior adversário em Kirei Kotomine, um sacerdote que busca a salvação do vazio dentro de si em busca de Kiritsugu.
Baseado no romance leve escrito pelo Gen Urobuchi, Fate/Zero retrata os acontecimentos da Quarta Guerra do Santo Graal;10 anos antes do Destino/Noite de Estadia. Testemunha uma batalha royale na qual ninguém tem a garantia de sobreviver.
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