Um ano se passou desde a Rebelião Negra, uma revolta fracassada contra o Santo Império Britânico, liderada pelo vigilante mascarado Zero, que agora está desaparecido. Sem seu líder revolucionário, o grupo de resistência da Área 11' os Cavaleiros Negros— se vêem demasiado impotentes para combater a brutalidade infligida aos Elevens pela Britânia, que aumentou significativamente para esmagar qualquer esperança de uma futura revolta.
Lelouch Lamperouge, tendo perdido toda a memória de sua vida dupla, está vivendo pacificamente ao lado de seus amigos como um estudante do colegial da Academia Ashford. Seu ex-sócio C.C., incapaz de aceitar esta reviravolta, se encarrega de lembrá-lo de seu propósito passado, esperando que o mestre Zero se levante mais uma vez para terminar o que começou, nesta emocionante conclusão da série.
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