Usagi Tsukino continua a lutar para equilibrar a sua vida doméstica com os deveres de ser Marinheiro Lua, o guardião do amor e da justiça. Juntamente com os outros marinheiros guardiães e o seu namorado Mamoru Chiba, começam a investigar casos de estudantes da Academia Mugen, uma escola para a maioria dos estudantes de elite, que estão a ser transformados em monstros. Durante a investigação, eles conhecem três indivíduos estranhos: Haruka Tenou, uma bela piloto de carros de corrida; Michiru Kaiou, um violinista talentoso; e Hotaru Tomoe, uma rapariga misteriosa com uma constituição fraca.
À medida que ocorrem mais incidentes, os Marinheiros Guardiães são recebidos com outra surpresa – o aparecimento de dois novos protectores planetários com motivações próprias. Apesar da duvidosa lealdade dos recém-chegados a Usagi e aos seus camaradas, todos eles enfrentam uma ameaça de um inimigo comum: uma entidade maligna que se autodenomina Faraó 90.
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