Este é um mundo onde existem homens e monstros. Aqueles que caçam os monstros são chamados de Hunters (caçadores). Mas em um pequeno canto do mundo dos Hunters, há aqueles chamados Riders que se unem e coexistem com os monstros. Com suas Kizuna Ishi (Pedras de Ligação), que lhes permitem despertar o poder oculto dentro dos monstros, os Riders vivem em segredo junto com seus Otomon, os monstros com os quais se conectaram.
Ryuto, um garoto que vive na vila de Hakum, sonha em se tornar o melhor Rider do mundo. Tendo acabado de completar 12 anos, ele se propõe a encontrar seu próprio Otomon antes da cerimônia em que recebe seu próprio Kizuna Ishi. Junto com seu bondoso amigo de infância, Cheval, sua curiosa amiga de infância, Lilia, e seu parceiro Naville, ele parte para as profundezas da floresta e tem um encontro milagroso com um Rathalos.
(Fonte: ANN, editado)