O Projeto Babylon é uma renovação maciça dos bairros de Tóquio, incluindo a criação de ilhas artificiais na baía. Utilizando “Labors”, ou robôs criados com o propósito expresso de fazer o trabalho, arquitetos e equipes de construção conseguem progredir com mais eficiência no desenvolvimento da reforma. Quando uma figura-chave na concepção do projeto é encontrada morta depois de cometer suicídio em circunstâncias misteriosas, a unidade policial Patlabor do capitão Kiichi Gotou é encarregada de chegar ao fundo da situação bizarra.
À medida que vários Labors começam a dar errado e um programa de IA hackeado coloca em risco a população de Tóquio, a jovem piloto Noa Izumi e seu Patlabor Alphonse trabalham sob as ordens de Gotou para salvar a cidade e toda a nação de uma enorme conspiração bíblica.
[Escrito por MAL Rewrite]