Verão 1986

No Universal Century 0088, o Anti-Earth Union Group (AEUG) saiu vitorioso na guerra contra os Titãs da Federação Terrestre, mas pagou um preço alto por isso. A Neo-Zeon, a terceira facção na guerra, antes conhecida como Axis Zeon, continua tão poderosa como sempre. Liderada pela Newtype Haman Karn, a Neo-Zeon tem implementado planos para dominar tanto a Terra quanto as colônias espaciais.

A nave capitânia da AEUG, Argama, dirige-se à colônia Side 1 Shangri-La para reparos. Vivendo na colônia está Judau Ashta, um sucateiro de 14 anos que luta para ganhar dinheiro suficiente para pagar os estudos de sua irmã mais nova. Após a descoberta de uma cápsula de fuga contendo um ex-piloto dos Titãs, Judau e seus amigos são rapidamente levados à Argama na esperança de roubar um traje móvel que possam vender por uma fortuna. No entanto, com a chegada de uma nave Neo-Zeon que busca derrotar a Argama, Judau e seus amigos são arrastados para um conflito que os levará pelo espaço e pela Terra.

Na cidade de Clock Hill, há uma antiga pensão chamada Maison Ikkoku. Embora a residência em si seja bastante normal, a maioria dos seus ocupantes não o é. Yuusaku Godai, seu inquilino mais quieto, finalmente atingiu seu limite com as constantes perturbações e festas barulhentas de seus vizinhos. Querendo um lugar mais calmo para chamar de casa para poder estudar em paz, ele se prepara para se mudar.

No entanto, seus planos de sair são subitamente interrompidos quando ele conhece a nova gerente da pensão, Kyoko Otonashi. Apaixonando-se perdidamente por ela, ele decide que a pensão pode não ser um lugar tão ruim para se viver, afinal. Infelizmente para ele, Kyoko tem seus próprios problemas românticos: ela é uma viúva cujo marido morreu seis meses depois de casados. E apesar de seus sentimentos florescentes por Godai, Kyoko ainda valoriza seu falecido marido e acredita que nenhum outro homem poderia preencher o vazio em seu coração. Mas com a persistência de Godai e a ajuda de outros inquilinos excêntricos, ela poderá experimentar o amor verdadeiro mais uma vez.

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