Após escapar de um sequestro de ônibus com a ajuda de um super-herói mascarado Strange Juice, Yuuta Iridatsu encontra sua alma separada de seu corpo e aos cuidados de um espírito perverso de gato, Chiranosuke. Como espírito, Yuuta vagueia por sua residência, a Casa Korai, com o objetivo de recuperar seu corpo e observar os outros residentes: Meika Daihatsu, um inventor genial; Mikatan Narugino, um ídolo alegre; Ito Hikiotani, um NEET fechado; e Rabura Chichibu, um médium espiritual. Após vislumbrar a roupa de baixo de Narugino's, Chiranosuke revela à Yuuta que ele se torna exponencialmente mais forte ao ver a calcinha. Entretanto, se ele vê outro par enquanto ainda é um espírito, seu poder fará com que um asteróide caia na terra, acabando com o mundo e matando seus amigos.
Punch Line segue Yuuta enquanto ele desvenda os mistérios que envolvem a Casa Korai, seus moradores e uma organização vilã que tenta acabar com o mundo. Yuuta será capaz de salvar a todos, ou a ameaça sempre presente das calcinhas resultará em sua desgraça?
[Escrito por MAL Rewrite]