Enquanto a Quarta Guerra do Graal continua sem um vencedor claro à vista, os restantes Servos e seus Mestres são chamados pelo supervisor da Igreja Risei Kotomine, a fim de se unirem e enfrentarem uma ameaça iminente que poderia desvendar a Guerra do Graal e provocar a destruição da cidade de Fuyuki. As tréguas inquietantes logo se desmoronam quando os Mestres demonstram que farão qualquer coisa em seu poder, por mais desprezível que seja, para vencer.
Sementes de dúvida são semeadas entre Kiritsugu Emiya e Saber, seu Servo, enquanto suas ideologias conflituosas sobre heroísmo e cavalheirismo se chocam. Entretanto, forma-se um vínculo sinistro entre Kirei Kotomine, que ainda procura encontrar o seu propósito na vida, e um dos Servidores restantes. Quando a contagem regressiva para o final da guerra chega a zero, o custo da vitória começa a desfocar a linha entre a vitória e a derrota.
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