Shinichi Kudou, um estudante do ensino médio de surpreendente talento no trabalho de detetive, é bem conhecido por ter resolvido vários casos desafiadores. Um dia, quando Shinichi detecta dois homens suspeitos e decide segui-los, ele inadvertidamente se torna testemunha de uma atividade ilegal perturbadora. Infelizmente, ele é apanhado em flagrante, então os homens o doseiam com uma droga experimental formulada por sua organização criminosa, deixando-o para sua morte. Entretanto, para seu próprio espanto, Shinichi vive para ver outro dia, mas agora no corpo de uma criança de sete anos.
Preservando perfeitamente sua inteligência original, ele esconde sua verdadeira identidade de todos, incluindo seu amigo de infância Ran Mouri e seu pai, o detetive particular Kogorou Mouri. Para isso, ele assume o pseudônimo de Conan Edogawa, inspirado pelos escritores misteriosos Arthur Conan Doyle e Ranpo Edogawa.
O detetive Conan segue Shinichi que, como Conan, começa a resolver secretamente os casos de Mouri's sénior a partir dos bastidores com sua ainda excepcional habilidade de investigação, enquanto investiga secretamente a organização responsável por seu estado atual, esperando reverter os efeitos da droga's um dia.
[Escrito por MAL Rewrite]
