Jubei Kibagami vagueia pelo Japão feudal como um espadachim itinerante de aluguer. Depois de uma traição passada o ter deixado sem dono, já não tem paciência para as facções políticas beligerantes e os seus esquemas. Infelizmente, tanto o passado como a intriga política colidem quando ele conhece e salva uma ninja feminina chamada Kagero de um homem com a capacidade de tornar o seu corpo tão duro como pedra.
Único sobrevivente de um clã ninja, Kagero continua a sua equipa's última missão: investigar uma misteriosa praga que exterminou uma aldeia inteira. Jubei não quer ter nada a ver com isto, mas os aliados de Jubei, um grupo de ninjas com poderes sobrenaturais conhecidos como os Demónios de Kimon, tornam essa opção difícil. Para piorar a situação, um espião governamental envenena Jubei, prometendo-lhe um antídoto se ele conseguir desvendar as verdadeiras intenções dos Demónios de Kimon e a sua ligação com a peste. O rasto leva a líderes-sombra, uma conspiração para derrubar o governo, e um homem que Jubei pensava que nunca mais voltaria a ver.
