Após anos de guerra infrutífera entre os quatro reinos da Gamindustri (Planeptune, Lastation, Lowee e Leanbox) sobre a energia Share, a fonte de sua força baseada no quanto seu povo tem fé em suas deusas, os quatro CPUs que governam sobre eles finalmente assinaram um tratado de amizade. O tratado proíbe qualquer tentativa de reivindicar a energia Share através da força militar, na esperança de trazer paz e prosperidade a seus mundos. No entanto, um mês após o tratado, Neptuno, a deusa CPU de Planeptune, passa seu tempo brincando e brincando em vez de fazer seu trabalho, deixando sua terra's Shares afundando.
Choujigen Game Neptune A Animação segue Neptune e seus amigos' tentativas de levantar Ações, enquanto lida com uma ameaça externa que poderia soletrar o fim tanto das Deusas como da própria Gamindustri…
