Há 50 anos atrás, um gigante extraterrestre de luz conhecido como Ultraman salvou a terra, mas desapareceu. Ultraman'o hospedeiro humano de Ultraman, Shin Hayata, ficou sem memória do seu tempo como herói. O jovem filho de Hayata's, Shinjirou, nasceu com um corpo mais poderoso e durável do que qualquer humano normal. A organização que ajudou Ultraman, o SSSP, revela o passado de Hayata's para ele. Seu pai, então, veste um terno de poder novamente, assumindo o papel de Ultraman mais uma vez.
Uma noite, Shinjirou é atacado por um alienígena chamado Bemular e resgatado por seu pai, que está gravemente ferido na batalha. Com alienígenas perigosos à espreita na cidade e Hayata fora de serviço, cabe a Shinjirou pegar a tocha. Mas ao trabalhar com o SSSP como o novo Ultraman, Shinjirou se pergunta até onde ele está disposto a ir para ajudar as pessoas.
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